Para além de uma equipa interna com conhecimentos sólidos nas diversas áreas abrangidas pelo projeto, a gestão do LIFE ÁGUEDA (LIFE16 ENV/PT/000411) inclui uma interação continuada e colaboração estreita com partes interessadas associadas aos trabalhos previstos. Estas entidades foram envolvidas na definição do projeto e integram a Comissão de Acompanhamento, uma estrutura de apoio e consulta em questões que se consideram importantes para alcançar os objetivos preconizados.
De entre os membros dessa Comissão, destaca-se a presença de um conjunto de parceiros institucionais cuja atividade e/ou funções são particularmente relevantes para os trabalhos do projeto:
a APA - Agência Portuguesa do Ambiente, a autoridade pública nacional com funções e responsabilidades na aplicação das Políticas Europeias relacionadas com a água e clima;
o ICNF - Instituto da Conservação da Natureza e das Florestas, autoridade pública nacional com funções e responsabilidades na aplicação das Políticas Europeias relacionadas com a conservação da natureza e biodiversidade;
a DGRM – Direção-Geral de Recursos Naturais, Segurança e Serviços Marítimos, serviço público da administração central do Estado que tem por missão, entre outros, a execução das políticas nacionais de preservação dos recursos naturais marinhos e de pesca;